在新生兒中唇腭裂占0.17%,男孩兒比女孩兒唇腭裂要高,腭裂占唇裂的一半。而且女孩又比男孩患唇腭裂的率要高,唇腭裂不僅與遺傳有關,受環境因素的影響也很大。
環境因素包括孕婦在妊娠期,特別是妊娠的前三個月,胎兒的唇或者是腭已形成階段,受到某種因素的干擾,如風疹病毒,某種藥物感染。
唇腭裂隱性基因如果沒有遇到相同的隱性基因,就是遺傳幾代也不顯見病狀,無任何的異常特征,所以說唇腭裂會有遺傳因素,唇腭裂會由多個基因來決定。父母一方唇腭裂或者女子患病可能性會在4%,孫子孫女和外孫子外孫女的患病率可能在0.7%,在下一代的患病可能是0.3%,也就是說親緣關系越遠發病的幾率就越小。
唇腭裂是一種常見的先天性疾病,發病率為1%,再發危險為4%,父為患者得發生率為3%,母為患者后代發生率為14%。