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福建醫(yī)科大學附屬第二醫(yī)院第二臨床醫(yī)學院是泉州地區(qū)現(xiàn)代醫(yī)學的發(fā)祥地，迄今已走過一百二十六年的歷程，現(xiàn)已發(fā)展成為我省主要的醫(yī)療、教學、科研基地之一，是閩南地區(qū)最早的一所三級甲等綜合性醫(yī)院及博士、碩士研究生學位授權(quán)點單位。醫(yī)院始建于1881年，為英國教會醫(yī)院，原名“惠世醫(yī)院”，解放后，改為晉江專區(qū)第二醫(yī)院。1973年升格為福建醫(yī)科大學附屬第二醫(yī)院。2000年成為福建醫(yī)科大學第二臨床醫(yī)學院，2002年成為福建醫(yī)學會風濕病學分會主任委員單位。醫(yī)院倡導科學精神與人文精神相結(jié)合的治院方略，歷來以外科技術(shù)精湛著稱，上世紀四、五十年代率先在泉州地區(qū)開展大、中型外科手術(shù)，并為泉州地區(qū)培養(yǎng)了大批醫(yī)學骨干力量。近二十年來，內(nèi)科領(lǐng)域在相關(guān)學科帶頭人開拓領(lǐng)導下，學科建設長足發(fā)展，多個二級專業(yè)躍入省內(nèi)先進水平，其中自身免疫風濕病專業(yè)省內(nèi)領(lǐng)先。現(xiàn)任院長是我省自身免疫風濕病學科帶頭人、博士生導師、國家衛(wèi)生部有突出貢獻中青年專家。

醫(yī)院原址地處歷史文化名城---僑鄉(xiāng)泉州，占地23.07畝，建筑面積44557平方米，2006年市政府在東海組團劃撥142.6畝建設我院“東海分院”，該項目現(xiàn)已納入泉州市十一五發(fā)展規(guī)劃，列為重點項目。

醫(yī)院病床編制670張，在編職工1046人，具備高級職稱186人，其中正、副教授91人，有博士研究生導師4人、碩士研究生導師35人，享受國務院特殊津貼專家4人、衛(wèi)生部有突出貢獻中青年專家1人。擔任專業(yè)學會主任委員1人，各專業(yè)學會副主任委員（副會長）20人、常務委員（常務理事）30人、委員（理事）86人。

醫(yī)院科室門類齊全，設有急診科、內(nèi)一科、免疫與血液內(nèi)科、內(nèi)二科、呼吸內(nèi)科、神經(jīng)內(nèi)科、特需內(nèi)科、康復科、華僑干部病房、兒科、中醫(yī)科、骨科、普外科、腫瘤與心胸外科、泌尿外科、神經(jīng)外科、婦產(chǎn)科、特需產(chǎn)科、耳鼻咽喉科、眼科、口腔科、皮膚科、特外一、特外三、手術(shù)室、麻醉科等27個臨床科室、35個二級專科，還設有11個醫(yī)技科室、ICU、CCU和20個職能科室。在風濕免疫科、超聲醫(yī)學科、心血管科、呼吸內(nèi)科、普外科、泌尿外科、骨科、內(nèi)分泌科、耳鼻喉科、腎內(nèi)科、肝膽外科、胸外科、消化道腫瘤外科、整形外科、婦產(chǎn)科和眼科等專科尤為專長。自身抗體譜檢測及內(nèi)分泌激素測定項目齊全。醫(yī)院在開拓醫(yī)學新領(lǐng)域、探索新技術(shù)新療法方面一直處于領(lǐng)先地位，幾十個新的診療技術(shù)達到國內(nèi)或省內(nèi)先進水平，如微創(chuàng)外科技術(shù)、支氣管鏡介入診療技術(shù)、超聲介入診療技術(shù)、心血管超聲診斷、放射學介入診療技術(shù)、腎移植、角膜移植、全喉切除發(fā)音重建術(shù)、人工椎體轉(zhuǎn)換術(shù)、臂叢神經(jīng)損傷修復術(shù)、體外循環(huán)心內(nèi)直視手術(shù)、腦干腫瘤摘除術(shù)、斷指再植術(shù)等。優(yōu)秀的人才、精良的設備和設置齊全的醫(yī)學專科為廣大民眾提供了全方位的醫(yī)療、保健服務，醫(yī)院目前年門診量50多萬人次、年住院量超過2萬人次、完成各類手術(shù)1.6萬余臺。

此外醫(yī)院設有自身免疫病研究室、介入超聲研究室、肝膽研究二室、耳鼻喉研究三室、手外科研究室、糖尿病研究室、腎病研究室、骨科生物力學研究室、睡眠呼吸研究室等9個研究室，其研究領(lǐng)域廣泛，研究程度涉及細胞水平及分子水平，2001年以來共有28項科研項目獲得醫(yī)學科學技術(shù)進步獎，96項研究項目得到政府或研究基金的資助，有1230篇論文發(fā)表于國內(nèi)外學術(shù)期刊。醫(yī)院作為福建醫(yī)科大學第二臨床醫(yī)學院及省級醫(yī)學繼續(xù)教育基地之一，還設有12個醫(yī)學教研室，并于1998年開始招收全國統(tǒng)招碩士研究生、2003年招收全國統(tǒng)招博士研究生，迄今已招收博、碩士研究生113人。

1981年，經(jīng)省政府批準，醫(yī)院在本省率先建立華僑門診、華僑病區(qū)。二十多年來接受大量來自美國、日本、新加坡、菲律賓、印度尼西亞、香港、臺灣及其他東南亞地區(qū)的病人。愛國僑胞熱心桑梓、慷慨解囊為醫(yī)院的建設作出了積極的貢獻。福建醫(yī)科大學附屬第二醫(yī)院歷任領(lǐng)導及全體同仁都非常珍視廣大僑胞及社會各界對該醫(yī)院的關(guān)愛及支持。

“博大精深仁心惠世”為百年老院的當代院訓。醫(yī)院將繼續(xù)發(fā)揮人才優(yōu)勢，發(fā)揚良好的醫(yī)德醫(yī)風，提高醫(yī)療服務質(zhì)量，堅持以“病人為中心”的服務宗旨，為廣大患者提供優(yōu)質(zhì)的醫(yī)療服務。

醫(yī)院擁有全身螺旋CT、全身MRI、數(shù)字減影心血管造影裝置（DSA）、直線加速器、模擬定位機、數(shù)字化胃腸造影機、多功能數(shù)字X光機、眼底及脈絡膜熒光造影儀、心臟、腹部及周圍血管彩色多普勒超聲診斷儀、黑白B超機、體外震波碎石機、集束電極射頻治療系統(tǒng)、連續(xù)性腎臟替代治療儀、電子胃鏡、電子腸鏡、電子支氣管鏡、24小時動態(tài)心電圖儀、24小時動態(tài)血壓監(jiān)測儀、活動平板儀、24小時腦電圖機、多功能視誘發(fā)電位儀、各種聽覺檢查設備、肌電圖機、體外循環(huán)機、全自動免疫分析儀、全自動生化分析儀、全自動血球計數(shù)儀、全自動細菌檢測培養(yǎng)儀、流式細胞分析儀、全自動血凝儀、乳腺X光機、全身骨密度儀、高壓氧艙、麻醉機、呼吸機、各種手術(shù)顯微鏡及ICU、CCU監(jiān)護系統(tǒng)等大型先進設備和齊全的常規(guī)檢查設備，總價值達1.12198億元（不含MRI），其中50萬元以上設備有38臺。